A ARH do Tejo tem como missão proteger e valorizar as componentes ambientais das águas, bem como proceder à gestão sustentável dos recursos hídricos no âmbito da sua área geográfica de atuação. Neste sentido, são atribuições de maior relevo para a atividade do Laboratório:
- Estabelecer na região hidrográfica uma rede de monitorização da qualidade da água; elaborar e aplicar o respetivo programa de monitorização de acordo com os procedimentos e a metodologia definidos pela Autoridade Nacional da Água;
- Elaborar o registo das zonas protegidas e identificar as zonas de captação destinadas à produção de água para consumo humano.

A Divisão de Laboratórios da ARH do Tejo compreende duas unidades laboratoriais: a sede em Lisboa e uma extensão nas Caldas da Rainha. São competências desta Divisão:
- Garantir a realização de análises e a disponibilização de resultados analíticos, no âmbito dos programas de monitorização em curso na ARH do Tejo;
- Apoiar as ações de fiscalização e elaboração de diagnósticos a causas de acidentes ou problemas ambientais;
- Prestar serviços, no âmbito das suas competências, a entidades externas;
- Promover ações de formação técnica e qualificação dos recursos humanos na área dos ensaios analíticos (químicos e microbiológicos) e no âmbito da amostragem;
- Implementar e validar métodos analíticos no âmbito das atividades desenvolvidas no laboratório;
- Cumprir e fazer cumprir os requisitos exigíveis pela norma de referência da acreditação na Rede de Laboratórios do MAOT;
- Participar em exercícios Interlaboratoriais Nacionais e Internacionais, nas Comissões Técnicas de Normalização e nas Comissões Técnicas da Relacre – Rede Nacional de Laboratórios Acreditados.
Organigrama do Laboratório